Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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