Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim41Q5NCC3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim41Q5NCC3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms