Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eme2Q56A04 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms