Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms