Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc3lQ4KL14 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms