Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pfdn4Q3UWL8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pfdn4Q3UWL8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pfdn4Q3UWL8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pfdn4Q3UWL8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pfdn4Q3UWL8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pfdn4Q3UWL8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pfdn4Q3UWL8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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