Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms