Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm29609Q3UU56 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm29609Q3UU56 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm29609Q3UU56 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm29609Q3UU56 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm29609Q3UU56 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm29609Q3UU56 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm29609Q3UU56 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm29609Q3UU56 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm29609Q3UU56 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm29609Q3UU56 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm29609Q3UU56 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm29609Q3UU56 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm29609Q3UU56 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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