Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms