Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms