Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms