Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms