Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Q3U6N9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Q3U6N9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.6 ms