Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U595 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U595 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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