Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms