Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ulk3Q3U3Q1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms