Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms