Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms