Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms