Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms