Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms