Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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