Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms