Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms