Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hddc2Q3SXD3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hddc2Q3SXD3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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