Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gli2Q0VGT2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gli2Q0VGT2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gli2Q0VGT2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gli2Q0VGT2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gli2Q0VGT2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gli2Q0VGT2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms