Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ttc39dQ0VF76 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ttc39dQ0VF76 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ttc39dQ0VF76 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ttc39dQ0VF76 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ttc39dQ0VF76 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ttc39dQ0VF76 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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