Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms