Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms