Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms