Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms