Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms