Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms