Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnn1Q08091 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms