Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms