Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms