Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms