Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms