Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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