Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms