Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec23aQ01405 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms