Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms