Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms