Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms