Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms