Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 331.9 ms