Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Arf1P84078 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Arf1P84078 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Arf1P84078 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Arf1P84078 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Arf1P84078 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Arf1P84078 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Arf1P84078 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Arf1P84078 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Arf1P84078 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Arf1P84078 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Arf1P84078 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Arf1P84078 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Arf1P84078 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms