Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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