Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms