Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SbdsP70122 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SbdsP70122 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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